97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0835 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  89.35 
 
 		 307 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  85.53 
 
 		 306 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  83.22 
 
 		 306 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  89.35 
 
 		 307 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  74.42 
 
 		 306 aa  478  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.52 
 
 		 304 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  72.52 
 
 		 303 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  67.88 
 
 		 303 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  69.23 
 
 		 306 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  69.57 
 
 		 306 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  69.57 
 
 		 306 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.08 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  68.23 
 
 		 307 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  67.56 
 
 		 306 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.74 
 
 		 313 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  67.89 
 
 		 307 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.33 
 
 		 305 aa  417  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  65.33 
 
 		 307 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  66.56 
 
 		 305 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.56 
 
 		 305 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  66.89 
 
 		 305 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  66.56 
 
 		 305 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  66.56 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  65.45 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.67 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.22 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  65.76 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  66.89 
 
 		 307 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  63.73 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  67.23 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.89 
 
 		 320 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.89 
 
 		 320 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.16 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  65.68 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  42.07 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  42.57 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  45.39 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  41.94 
 
 		 337 aa  228  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  39.01 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  44.69 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.88 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  44.85 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.38 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  41.13 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.54 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.04 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.25 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.15 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  38.35 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  34.84 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  38.79 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  36.94 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  36.88 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  36.24 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  37.92 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  35.5 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  34.96 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  33.7 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.36 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  36.26 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  87.76 
 
 		 130 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  36.59 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.09 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  35.07 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  35.34 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  37.77 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.1 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  35.84 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.93 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  23.77 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  22.58 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.61 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  22.4 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.81 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  23.34 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.53 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  25.53 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  25.53 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  23.51 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.75 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  24.01 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  21.25 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  23.91 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  21.25 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  22.38 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.59 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.59 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.72 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.88 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  24.9 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.36 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.17 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  30.91 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.23 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  33.87 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>