92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1530 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 327 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  79.35 
 
 		 315 aa  517  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  64.26 
 
 		 323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  62.08 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.84 
 
 		 322 aa  345  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  56.94 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  46.47 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  47.18 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  44.81 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.79 
 
 		 330 aa  255  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  44.04 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  42.96 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.6 
 
 		 316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.29 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  38.13 
 
 		 303 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  40.57 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  37.54 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  40.78 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.38 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  38.72 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  38.96 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  39.47 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.15 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.15 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  41.79 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.03 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.78 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.03 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.62 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.66 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.62 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  37.17 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.62 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  40 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  40.38 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  40.38 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  40 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  39.62 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  38.97 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  39.62 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.08 
 
 		 303 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  36.43 
 
 		 291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.02 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.85 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.85 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.61 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  38.08 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  37.37 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  38.08 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.87 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  37.69 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  36.01 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.11 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.11 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  40 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.43 
 
 		 277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  36.56 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.91 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  35.11 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.1 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  38.38 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  38.73 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.73 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  37.82 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  35.16 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  34.22 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  25.38 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  24.3 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.3 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  24 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.21 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  26.09 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  41.03 
 
 		 130 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  25.09 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  25.09 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.99 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  23.73 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.72 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  23.26 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.67 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  23.31 
 
 		 545 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  25.48 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.22 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.22 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1321  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.41 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00529939  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  23.81 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1595  hypothetical protein  66.67 
 
 		 101 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.59 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  23.76 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>