More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2346 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2346  elongation factor Ts  100 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00299085  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0122  elongation factor Ts  39.07 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.616423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  39.45 
 
 		 267 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  36.21 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  36.75 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  36.55 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  34.52 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  33.93 
 
 		 286 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  33.33 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  36.09 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  33.79 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  36.86 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  36.33 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  37.09 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  33.1 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  36.64 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  33.9 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2734  translation elongation factor Ts  38.54 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  36.3 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  34.48 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  36.05 
 
 		 308 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  34.93 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  34.01 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  32.77 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  34.01 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  35.38 
 
 		 292 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  35.38 
 
 		 292 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  36.64 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  32.32 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  35.71 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  33.67 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  34.13 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  34.8 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  34.97 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  33.67 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  33.56 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  34.24 
 
 		 310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  34.9 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  31.29 
 
 		 314 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  34.12 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  32.94 
 
 		 355 aa  153  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  33.33 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  33.79 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  33.81 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  33.96 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  30.26 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  34.2 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  35.58 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  30.99 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  33.94 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  33.56 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  29.97 
 
 		 357 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  29.97 
 
 		 357 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  32.07 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  32.76 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  34.86 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  30.41 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0649  translation elongation factor Ts  33.45 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.301511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  35.06 
 
 		 292 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  34.07 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  36.05 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  34.83 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  34.42 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  31.69 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  33.84 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  35.19 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  30.99 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  34.56 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  34.34 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  34.78 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  33.8 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  34.78 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  34.14 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  34.47 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  33.8 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  35.79 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  33.45 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  31.72 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  35.36 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  32.2 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  32.2 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  31.47 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  33.71 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  33.78 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  33.89 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  33.1 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  34.12 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  30.9 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  33.9 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  31.97 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  30.75 
 
 		 348 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  32.87 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  30.5 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  30.66 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  28.03 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  33.97 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  34.34 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  33.58 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  32.51 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  32.21 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>