More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2343 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2343  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0119  phosphatidate cytidylyltransferase  36.27 
 
 
283 aa  139  7e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  32.74 
 
 
262 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  32.53 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.07 
 
 
275 aa  95.5  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.42 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  32.52 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.52 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  32.52 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  29.79 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  32.52 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  32.52 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  32.24 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  32.52 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  32.52 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
268 aa  94  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  42.75 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
281 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  30.18 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  30.18 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  32.75 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  30.18 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 
285 aa  92  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  32.64 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  38.41 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  28.05 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  29.79 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  28.98 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.61 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  37.68 
 
 
285 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.17 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  29.68 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  29.58 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  37.86 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 
280 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  44.64 
 
 
295 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  34.22 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  33.74 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  28.19 
 
 
289 aa  85.9  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
280 aa  85.5  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  35.43 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  33.52 
 
 
233 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  38.03 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  39.53 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  35.46 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  35.1 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  26.95 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  37.93 
 
 
285 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  34.65 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  28.37 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  34.65 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  28.01 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  34.87 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  40.34 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  29 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  30.54 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  28 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  37.93 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  37.93 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  39.5 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  34.85 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  28.97 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  34.72 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  33.53 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  26.21 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  37.25 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  34.73 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>