More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0774 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0774  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  64.62 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  63.08 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  64.84 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  63.85 
 
 		 139 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  63.85 
 
 		 139 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  61.54 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0496  50S ribosomal protein L16  63.08 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  61.83 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  64.84 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  65.38 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  60.77 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  63.28 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  63.28 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  64.06 
 
 		 139 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 147 aa  173  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 		 142 aa  172  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  60.77 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  58.27 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  61.72 
 
 		 139 aa  170  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 141 aa  170  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  60.16 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  62.31 
 
 		 145 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  63.28 
 
 		 139 aa  169  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  60.16 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  61.54 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  60.31 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  59.54 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  60.77 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  60.94 
 
 		 139 aa  168  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  56.93 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  60.94 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  60.77 
 
 		 140 aa  166  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  60.94 
 
 		 139 aa  166  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  64.62 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  60 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  56.2 
 
 		 141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  57.25 
 
 		 144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 179 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  62.12 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  55.73 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  60.77 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  57.03 
 
 		 141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  60.77 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  56.49 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  59.23 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0284  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00023435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 138 aa  159  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  58.59 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  59.54 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  57.55 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  57.69 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  57.25 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  56.25 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  58.59 
 
 		 139 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  56.49 
 
 		 144 aa  157  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  59.38 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  57.81 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  57.69 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  57.69 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  57.03 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  57.69 
 
 		 138 aa  157  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2058  ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000772955  normal  0.0851183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  54.48 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  57.81 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0263  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0210  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  58.91 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  57.69 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  56.15 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  55.38 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0057  50S ribosomal protein L16  56.15 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274594  hitchhiker  4.45125e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  56.15 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0060  50S ribosomal protein L16  56.15 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  56.92 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>