More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0284 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0284  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00023435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  66.92 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  64.66 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  60.61 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  60.61 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 139 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 141 aa  166  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0272  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000575408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1177  ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00052699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 138 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0496  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0263  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0988  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.702357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3998  ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.869429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0345  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 138 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.739822  decreased coverage  0.000284726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4906  50S ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0575421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3788  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0821635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0774  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0280  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0285  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931697  hitchhiker  0.0000000330456 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 144 aa  160  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3012  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000599816  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2943  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000488638  hitchhiker  0.000000740815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3290  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000483098  decreased coverage  0.000000529176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  56.06 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_002620  TC0808  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0752891  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  58.33 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0210  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  54.41 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1271  50S ribosomal protein L16  57.58 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00776716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>