More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0808 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0808  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
138 aa  278  1e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0752891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
144 aa  185  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 
144 aa  183  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 
139 aa  183  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  64.18 
 
 
151 aa  180  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  63.04 
 
 
140 aa  180  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0296  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 
140 aa  180  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
139 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 
144 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
142 aa  178  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
142 aa  178  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  65.44 
 
 
144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
142 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
139 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 
151 aa  176  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  60.29 
 
 
145 aa  176  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 
144 aa  176  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
139 aa  176  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 
141 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
140 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
143 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  59.42 
 
 
142 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 
139 aa  175  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
144 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 
147 aa  174  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 
141 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
144 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
140 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 
142 aa  173  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  58.7 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 
139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 
139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
144 aa  170  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  171  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
144 aa  170  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
144 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
140 aa  169  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  58.39 
 
 
138 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  61.76 
 
 
144 aa  169  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
149 aa  168  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 
144 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
149 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  58.7 
 
 
139 aa  168  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
137 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3988  ribosomal protein L16  60.29 
 
 
141 aa  168  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  168  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
144 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
144 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  58.96 
 
 
140 aa  168  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 
139 aa  168  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  57.46 
 
 
140 aa  168  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
137 aa  167  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  58.21 
 
 
145 aa  167  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 
142 aa  167  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
138 aa  167  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  58.96 
 
 
143 aa  167  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
138 aa  167  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  58.21 
 
 
141 aa  166  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
140 aa  166  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  54.41 
 
 
145 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1131  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 
142 aa  165  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508747  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1411  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 
136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  56.82 
 
 
141 aa  164  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
146 aa  164  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  55.47 
 
 
138 aa  164  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 
139 aa  163  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 
138 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 
138 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 
138 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  56.72 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>