More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0296 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0296  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
140 aa  288  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 
144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 
144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0808  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 
138 aa  180  6e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0752891  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  60.74 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 
144 aa  176  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
142 aa  176  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  61.94 
 
 
140 aa  174  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
144 aa  174  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
142 aa  174  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
142 aa  174  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
144 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
144 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 
144 aa  173  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
141 aa  173  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
145 aa  173  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
144 aa  173  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1131  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
145 aa  170  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
144 aa  169  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  59.56 
 
 
145 aa  169  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 
140 aa  168  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
140 aa  167  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
147 aa  167  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  58.96 
 
 
140 aa  167  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 
144 aa  167  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
144 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  56.52 
 
 
139 aa  167  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 
143 aa  166  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 
140 aa  165  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  60.9 
 
 
144 aa  166  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  58.39 
 
 
151 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 
139 aa  165  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
143 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0298  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 
145 aa  165  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.11723e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  54.35 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  54.35 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
138 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  54.35 
 
 
140 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  60.29 
 
 
144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 
145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  58.21 
 
 
140 aa  163  8e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  54.01 
 
 
145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  54.07 
 
 
139 aa  161  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 
139 aa  161  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  60.15 
 
 
143 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  53.73 
 
 
139 aa  161  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  54.74 
 
 
139 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
137 aa  161  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  54.35 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3988  ribosomal protein L16  58.21 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0988  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.702357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  55.64 
 
 
139 aa  160  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 
140 aa  160  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2395  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 
137 aa  160  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00185244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  56.72 
 
 
143 aa  159  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
137 aa  160  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  53.33 
 
 
138 aa  160  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
138 aa  159  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
137 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 
139 aa  158  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  54.07 
 
 
139 aa  157  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
138 aa  157  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  52.9 
 
 
140 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
142 aa  157  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
138 aa  157  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  55.97 
 
 
140 aa  157  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  52.63 
 
 
142 aa  156  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 
139 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  56.72 
 
 
138 aa  156  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  53.28 
 
 
139 aa  156  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  54.48 
 
 
139 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  57.46 
 
 
137 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  56.72 
 
 
138 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  54.07 
 
 
139 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  54.07 
 
 
139 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  53.73 
 
 
139 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 
139 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  51.47 
 
 
137 aa  155  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0219  50S ribosomal protein L16  52.9 
 
 
140 aa  154  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>