More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1411 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1411  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
139 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  60.29 
 
 
140 aa  178  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  63.7 
 
 
139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
144 aa  177  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
144 aa  175  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
139 aa  174  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  62.96 
 
 
145 aa  174  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
144 aa  173  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
139 aa  173  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
140 aa  173  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  58.52 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
140 aa  170  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
139 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  60.9 
 
 
140 aa  169  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
145 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  59.56 
 
 
143 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
147 aa  168  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1131  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 
142 aa  168  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4922  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
145 aa  167  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
151 aa  167  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
142 aa  167  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
142 aa  166  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 
142 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
140 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  59.26 
 
 
151 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
139 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
139 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0808  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 
138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0752891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  60 
 
 
137 aa  164  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 
144 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 
144 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  60 
 
 
140 aa  164  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
145 aa  163  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
140 aa  163  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
142 aa  163  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
142 aa  163  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  54.07 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  58.52 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  54.07 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
141 aa  161  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
141 aa  161  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
137 aa  161  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
141 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
140 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 
138 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  57.78 
 
 
145 aa  160  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
144 aa  160  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
138 aa  159  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
137 aa  159  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
137 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 
141 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
138 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 
141 aa  158  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 
160 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0988  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
139 aa  157  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.702357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
158 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
149 aa  157  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 
160 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
138 aa  156  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
149 aa  156  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  57.04 
 
 
140 aa  156  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3998  ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.869429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  53.33 
 
 
137 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
137 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
146 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1177  ribosomal protein L16  57.04 
 
 
139 aa  155  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00052699  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 
158 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  53.33 
 
 
137 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 
138 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
137 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  54.07 
 
 
137 aa  154  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0298  50S ribosomal protein L16  54.07 
 
 
145 aa  154  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.11723e-28 
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  52.59 
 
 
144 aa  154  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
137 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  54.41 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  52.59 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  53.68 
 
 
138 aa  153  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  53.68 
 
 
138 aa  153  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 
161 aa  153  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>