More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0765 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  100 
 
 
696 aa  1450    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.345904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 
559 aa  211  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.77 
 
 
540 aa  150  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
866 aa  148  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
565 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.71 
 
 
538 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 
576 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 
622 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 
538 aa  138  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
618 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
540 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
539 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.45 
 
 
546 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 
557 aa  124  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 
619 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 
563 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 
551 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 
512 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 
533 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.22 
 
 
516 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 
534 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 
628 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.64 
 
 
562 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 
545 aa  104  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 
544 aa  103  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 
594 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.55 
 
 
524 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.5 
 
 
580 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  24.5 
 
 
579 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
501 aa  101  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
536 aa  100  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.79 
 
 
545 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 
544 aa  100  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
575 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 
521 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
519 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1789  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
572 aa  97.4  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.22 
 
 
524 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 
517 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 
587 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0982  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 
567 aa  95.5  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 
554 aa  95.1  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
498 aa  94.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
556 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1532  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 
559 aa  93.2  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0243395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
526 aa  92  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.14 
 
 
545 aa  92.4  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
608 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
575 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 
600 aa  91.3  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.61 
 
 
575 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
567 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 
555 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.52 
 
 
562 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1420  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  23.5 
 
 
560 aa  89.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.57 
 
 
594 aa  89.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.72 
 
 
566 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0940  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 
559 aa  88.6  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.34 
 
 
555 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  27.54 
 
 
532 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 
519 aa  88.2  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.34 
 
 
575 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.34 
 
 
575 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.53 
 
 
531 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.43 
 
 
567 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 
553 aa  87.4  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.3 
 
 
525 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.61 
 
 
559 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
508 aa  86.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  25.07 
 
 
561 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  29.37 
 
 
593 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  25.36 
 
 
518 aa  85.1  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.34 
 
 
529 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.52 
 
 
526 aa  84.3  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.52 
 
 
526 aa  84.3  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 
528 aa  84  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 
529 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 
577 aa  84  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
534 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.01 
 
 
520 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 
534 aa  84  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
556 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 
528 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  22.7 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
505 aa  82.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.54 
 
 
575 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.93 
 
 
528 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
509 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.78 
 
 
556 aa  82.4  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.93 
 
 
528 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 
565 aa  82  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.24 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.93 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.93 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
538 aa  81.6  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 
527 aa  81.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.08 
 
 
531 aa  81.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>