More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0033 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0033  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
333 aa  684    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  31.48 
 
 
464 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1195  glutamyl-tRNA reductase  28.38 
 
 
394 aa  92.8  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  29.54 
 
 
436 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.32 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  27.62 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1021  Glutamyl-tRNA reductase  24.73 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  26.56 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  26.3 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 
425 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  24.2 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  25.96 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  28.24 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  27.87 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  32.29 
 
 
408 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  25.75 
 
 
419 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  25.34 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  23.93 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  25.26 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  25.26 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  28.04 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  29.36 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.64 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  26.85 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  29.36 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  28.25 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  27.91 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  29.86 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0189  glutamyl-tRNA reductase  23.81 
 
 
464 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  26.45 
 
 
465 aa  76.3  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  23.01 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  30.09 
 
 
425 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  24.23 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  28.64 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0176  glutamyl-tRNA reductase  23.89 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.115712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  25.71 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  27.23 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  30.66 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  29.17 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  24.05 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0311  glutamyl-tRNA reductase  25.73 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237446  normal  0.0249608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  28.7 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.78 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  25 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  24.36 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  24.05 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0688  glutamyl-tRNA reductase  25.38 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0940243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  24.05 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  28.37 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  29.91 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1424  glutamyl-tRNA reductase  24.1 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.778377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  29.49 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0770  glutamyl-tRNA reductase  23.1 
 
 
435 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  29.49 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  29.17 
 
 
428 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  29.49 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.46 
 
 
434 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  29.49 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  29.49 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  29.6 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  25.76 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
416 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.46 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  25.95 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  26.67 
 
 
456 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.58 
 
 
429 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  28.31 
 
 
440 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  26.67 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  25.96 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  26.58 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>