More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0311 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0311  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 451 aa  918    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237446  normal  0.0249608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0176  glutamyl-tRNA reductase  63.89 
 
 		 459 aa  581  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.115712 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0189  glutamyl-tRNA reductase  61.77 
 
 		 464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  39.87 
 
 		 418 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  39.87 
 
 		 418 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  39.87 
 
 		 418 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  39.87 
 
 		 418 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  39.33 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  39.64 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  39.64 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  39.64 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  39.64 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.46 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  38.89 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  39.11 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  39.42 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  40.72 
 
 		 418 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  40.72 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  40.27 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  38.75 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  38.75 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  38.75 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  38.75 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 		 418 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  42.07 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  38.75 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  39.59 
 
 		 420 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  37.99 
 
 		 424 aa  289  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  37.33 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  37.67 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  39.82 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  37.7 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  38.29 
 
 		 425 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.55 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  39 
 
 		 449 aa  276  8e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  38.41 
 
 		 425 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  37.01 
 
 		 416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  37.1 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  39.14 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  39.14 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  39.1 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  38.37 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  37.21 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  36.76 
 
 		 416 aa  270  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  37.25 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  36.65 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2180  glutamyl-tRNA reductase  39.14 
 
 		 438 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00403267  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 425 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  37.67 
 
 		 416 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  37.67 
 
 		 416 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  37.81 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 432 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  37.04 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  37.38 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  36.85 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  37.25 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  37.25 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  37.21 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  35.33 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 		 432 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 		 432 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  35.33 
 
 		 434 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  35.33 
 
 		 434 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  35.33 
 
 		 434 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  35.33 
 
 		 434 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  35.49 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  37.21 
 
 		 416 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.56 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  35.27 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  35.49 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  36.76 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  35.09 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  36.76 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  37.21 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  36.76 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  36.76 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  36.51 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  35.27 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  35.27 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 428 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.25 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  35.16 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  35.27 
 
 		 432 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  35.19 
 
 		 434 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  34.73 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  35.16 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  35.04 
 
 		 432 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  37.9 
 
 		 427 aa  252  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>