167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12730 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12730  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2171  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  71.93 
 
 
228 aa  341  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547728  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2217  PhzF family phenazine biosynthesis protein  71.93 
 
 
228 aa  341  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2160  PhzF family phenazine biosynthesis protein  71.93 
 
 
228 aa  341  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130516  hitchhiker  0.00465889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3953  PhzF family phenazine biosynthesis protein  68.42 
 
 
228 aa  314  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2444  PhzF family phenazine biosynthesis protein  67.25 
 
 
229 aa  297  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2053  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.01 
 
 
227 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7069  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.28 
 
 
235 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0288  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.1 
 
 
237 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.916406  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.12 
 
 
302 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.3 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.57 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.66 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.88 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.91 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.76 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07010  phenazine biosynthesis-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04380)  37.38 
 
 
363 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.26 
 
 
309 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.26 
 
 
309 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.46 
 
 
304 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.46 
 
 
331 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  36.75 
 
 
286 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.37 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.43 
 
 
286 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.43 
 
 
286 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.37 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.18 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.61 
 
 
311 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45 
 
 
306 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.44 
 
 
302 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.21 
 
 
293 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.96 
 
 
289 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.07 
 
 
286 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.45 
 
 
290 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.11 
 
 
306 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.34 
 
 
294 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.82 
 
 
290 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.33 
 
 
287 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.9 
 
 
305 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.53 
 
 
306 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.8 
 
 
309 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.84 
 
 
310 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.64 
 
 
305 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.82 
 
 
303 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.93 
 
 
285 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.58 
 
 
296 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.57 
 
 
303 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.38 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.04 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.38 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.24 
 
 
308 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.11 
 
 
301 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.89 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  34.86 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.24 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  29.41 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  29.41 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.67 
 
 
308 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.17 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  38.04 
 
 
305 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.87 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.85 
 
 
292 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.26 
 
 
288 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.5 
 
 
276 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.31 
 
 
279 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  28.38 
 
 
278 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  28.38 
 
 
278 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.5 
 
 
292 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.37 
 
 
279 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.14 
 
 
298 aa  52  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.11 
 
 
298 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.77 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.29 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.85 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.53 
 
 
293 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.05 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.36 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.25 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.29 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.58 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4858  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  26.81 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0126  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.85 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1604  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.36 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.8 
 
 
299 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.58 
 
 
299 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.58 
 
 
299 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  31.58 
 
 
299 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33 
 
 
292 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.67 
 
 
278 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.7 
 
 
299 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  31.67 
 
 
298 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  31.25 
 
 
278 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  39.51 
 
 
292 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3588  phenazine biosynthesis family protein  30.95 
 
 
277 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0113  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32 
 
 
276 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.88 
 
 
270 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.58 
 
 
299 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.98 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.05 
 
 
340 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.25 
 
 
287 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>