49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0288 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0288  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 		 237 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.916406  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7069  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.21 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2053  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.87 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2171  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.13 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2160  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.13 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130516  hitchhiker  0.00465889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2217  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.13 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12730  hypothetical protein  37.23 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3953  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.55 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2444  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.89 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.64 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.08 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  26.51 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.06 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.19 
 
 		 304 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.78 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.96 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.16 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.64 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.91 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.56 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.56 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.91 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.97 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.07 
 
 		 304 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1604  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.61 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  28.11 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  28.11 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  28.11 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.76 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  28.11 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.44 
 
 		 308 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.91 
 
 		 307 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.36 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.87 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.86 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.65 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.78 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.51 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.27 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  26.97 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.11 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.51 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.51 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.77 
 
 		 285 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  39.47 
 
 		 305 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.37 
 
 		 290 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  26.97 
 
 		 287 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.29 
 
 		 306 aa  42  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.25 
 
 		 285 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.639097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>