250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2053 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2053  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
227 aa  431  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2171  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.71 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547728  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2217  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.71 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2160  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.71 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130516  hitchhiker  0.00465889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0288  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.1 
 
 
237 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.916406  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7069  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.46 
 
 
235 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12730  hypothetical protein  41.74 
 
 
228 aa  154  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3953  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.86 
 
 
228 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2444  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.33 
 
 
229 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.64 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.57 
 
 
288 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.2 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.06 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.41 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.05 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  35.27 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  35.27 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  34.53 
 
 
278 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  34.53 
 
 
278 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.73 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.77 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.74 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.32 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.5 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.32 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.19 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4858  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.19 
 
 
292 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.95 
 
 
302 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.56 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.56 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.65 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.07 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.05 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  27.31 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.3 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.39 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.07 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.84 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.18 
 
 
288 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.64 
 
 
305 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.25 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.6 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.21 
 
 
298 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  30.83 
 
 
286 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.13 
 
 
301 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.65 
 
 
304 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.49 
 
 
288 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.5 
 
 
293 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.11 
 
 
285 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.25 
 
 
304 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1604  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.02 
 
 
305 aa  61.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.54 
 
 
285 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.35 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  40.65 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.84 
 
 
306 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.45 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.75 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  35.59 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.68 
 
 
289 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.94 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.55 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.84 
 
 
310 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.15 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.84 
 
 
311 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.82 
 
 
305 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.19 
 
 
306 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  22.92 
 
 
278 aa  58.9  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.7 
 
 
308 aa  58.9  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.7 
 
 
308 aa  58.9  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.36 
 
 
305 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.2 
 
 
299 aa  58.5  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.19 
 
 
319 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43 
 
 
290 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.24 
 
 
289 aa  58.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.75 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.44 
 
 
296 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.69 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.68 
 
 
308 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  47.22 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  34.38 
 
 
296 aa  57.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  45.95 
 
 
293 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.83 
 
 
292 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  29.56 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.84 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.52 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  21.21 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.02 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.54 
 
 
296 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2885  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.07 
 
 
309 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0846454  normal  0.375181 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.83 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.66 
 
 
306 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.91 
 
 
299 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.38 
 
 
331 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.35 
 
 
289 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.74 
 
 
291 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2922  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.15 
 
 
306 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.89 
 
 
292 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>