282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2885 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2885  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
309 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0846454  normal  0.375181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.01 
 
 
305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1315  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.44 
 
 
280 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.44 
 
 
278 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2922  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.67 
 
 
306 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.55 
 
 
281 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0549  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.65 
 
 
275 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2519  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.21 
 
 
283 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0145479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.64 
 
 
301 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0551  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.67 
 
 
287 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0805  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.49 
 
 
314 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.791564  normal  0.0825896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3588  phenazine biosynthesis family protein  36.99 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0126  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.68 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0838  putative phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.73 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0113  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.37 
 
 
276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.53 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.24 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28 
 
 
299 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.76 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.1 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.93 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.1 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.09 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.72 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000932469  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.86 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  30.77 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  31.44 
 
 
297 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.48 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  30.77 
 
 
297 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.77 
 
 
297 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.86 
 
 
299 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.23 
 
 
302 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  31 
 
 
297 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  30.43 
 
 
297 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.57 
 
 
299 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  29.15 
 
 
300 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.08 
 
 
295 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  24.83 
 
 
287 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.19 
 
 
289 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  30.88 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.07 
 
 
315 aa  99  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.45 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  29.43 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  29.43 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  29.43 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.84 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  29.43 
 
 
297 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  29.1 
 
 
297 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.16 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.06 
 
 
296 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.58 
 
 
278 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.67 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.95 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.95 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.74 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.03 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  31.97 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.5 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.87 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.08 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  30.21 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  30.21 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  30.21 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  30.21 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  36.19 
 
 
315 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.78 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.17 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.78 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.99 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.5 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.49 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.79 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2046  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.3 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00628004  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.49 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.22 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  23.97 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  24.54 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  23.97 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  28.98 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  23.97 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.77 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.02 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.81 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  23.79 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.62 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.06 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.73 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  23.62 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  23.64 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.25 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.54 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.53 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.11 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.6 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.04 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.29 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.82 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.17 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>