285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3108 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  47.02 
 
 
300 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  48.99 
 
 
297 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.99 
 
 
297 aa  261  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  47.65 
 
 
297 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  48.31 
 
 
297 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  47.96 
 
 
300 aa  260  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  47.97 
 
 
297 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  47.3 
 
 
297 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  47.3 
 
 
297 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  47.3 
 
 
297 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  47.3 
 
 
297 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  47.97 
 
 
297 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  46.96 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  44.26 
 
 
301 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.9 
 
 
302 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.61 
 
 
299 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.46 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  31.56 
 
 
299 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.45 
 
 
299 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.56 
 
 
299 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.07 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.23 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.56 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.56 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.44 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  31.23 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.23 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.9 
 
 
299 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  31.23 
 
 
299 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.31 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.27 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.71 
 
 
290 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.01 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.64 
 
 
287 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.44 
 
 
298 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.09 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.94 
 
 
304 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.93 
 
 
287 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.84 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.58 
 
 
290 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.27 
 
 
292 aa  119  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.57 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.92 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.57 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.92 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.92 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.34 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  31.16 
 
 
292 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.57 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.56 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.57 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.17 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.62 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.33 
 
 
302 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.43 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  28.52 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.01 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.23 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.33 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.99 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.23 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.71 
 
 
273 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.24 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2046  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.89 
 
 
301 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00628004  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.07 
 
 
309 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.56 
 
 
298 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.13 
 
 
288 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.33 
 
 
288 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.07 
 
 
309 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.75 
 
 
288 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.21 
 
 
280 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.03 
 
 
298 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.9 
 
 
292 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.9 
 
 
292 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.19 
 
 
276 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.6 
 
 
311 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.09 
 
 
309 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0549  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.41 
 
 
275 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.04 
 
 
301 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.54 
 
 
278 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  33.33 
 
 
298 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1560  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.58 
 
 
302 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.264367  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0551  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.56 
 
 
287 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.38 
 
 
292 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.04 
 
 
279 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.55 
 
 
283 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.89 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.11 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.32 
 
 
291 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  31.08 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.2 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.31 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.5 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.21 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0855  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.38 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.91 
 
 
289 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.57 
 
 
319 aa  96.3  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0805  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.96 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.791564  normal  0.0825896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>