281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2519 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2519  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
283 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0145479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  64.39 
 
 
278 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  65.47 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2922  PhzF family phenazine biosynthesis protein  63.7 
 
 
306 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1315  phenazine biosynthesis protein PhzF family  62.28 
 
 
280 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.2 
 
 
301 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0551  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.87 
 
 
287 aa  244  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0805  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.57 
 
 
314 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.791564  normal  0.0825896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48 
 
 
305 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0549  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.25 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0126  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.93 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0113  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.53 
 
 
276 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3588  phenazine biosynthesis family protein  44.96 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.24 
 
 
277 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000932469  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2885  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.21 
 
 
309 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0846454  normal  0.375181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0838  putative phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.61 
 
 
259 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.5 
 
 
287 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.93 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.46 
 
 
299 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  26.37 
 
 
299 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.71 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.05 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.21 
 
 
299 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.21 
 
 
299 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  26.03 
 
 
299 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.09 
 
 
299 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.43 
 
 
299 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.9 
 
 
304 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.76 
 
 
278 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.8 
 
 
299 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.75 
 
 
299 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30.42 
 
 
300 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.66 
 
 
297 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.97 
 
 
299 aa  99  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.8 
 
 
299 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.77 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.21 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  30.31 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.88 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.08 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.15 
 
 
307 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  31.25 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2046  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.44 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00628004  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.02 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.87 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.21 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.7 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.68 
 
 
302 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.45 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.45 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  30.38 
 
 
301 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  28.71 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  30.17 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  29.25 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  29.25 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  29.25 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.47 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.47 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.38 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  29.25 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.57 
 
 
309 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.72 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.64 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.76 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.83 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.67 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  25.94 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.38 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  26.04 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.49 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  26.04 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  30.57 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.04 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  26.37 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.04 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.45 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.94 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.77 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  26.1 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.82 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  30.15 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  30.15 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  31.34 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  32.4 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  33.22 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.04 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.42 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.04 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.56 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.38 
 
 
308 aa  79  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  30.51 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  30.51 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.56 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.89 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.58 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>