187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7069 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7069  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
235 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0288  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.66 
 
 
237 aa  177  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.916406  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2053  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.46 
 
 
227 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2171  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.16 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547728  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2217  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.16 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2160  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.16 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130516  hitchhiker  0.00465889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3953  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.39 
 
 
228 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2444  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.66 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12730  hypothetical protein  37.72 
 
 
228 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.1 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.86 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.01 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.14 
 
 
304 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.05 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.13 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.13 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.41 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.73 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.55 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  30.86 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.11 
 
 
279 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.11 
 
 
307 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.19 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.39 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.39 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.16 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.73 
 
 
288 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.05 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  28.97 
 
 
286 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.11 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  29 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  29 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  29 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  29 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.5 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.36 
 
 
288 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.73 
 
 
276 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.3 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.36 
 
 
301 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.35 
 
 
305 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.44 
 
 
303 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.46 
 
 
308 aa  58.9  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.46 
 
 
308 aa  58.9  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.5 
 
 
331 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.35 
 
 
306 aa  58.5  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.74 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.18 
 
 
289 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.5 
 
 
280 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.94 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.56 
 
 
289 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1604  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.68 
 
 
305 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  49.23 
 
 
293 aa  55.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.09 
 
 
293 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.86 
 
 
308 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.82 
 
 
306 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  41.1 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.48 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45 
 
 
310 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.32 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  27.21 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  40.23 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.87 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.52 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.1 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.23 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.63 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.47 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.78 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.48 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.05 
 
 
319 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.5 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.58 
 
 
299 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.99 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.77 
 
 
293 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.87 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.73 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.73 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.04 
 
 
292 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.84 
 
 
286 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62410  hypothetical protein  45.95 
 
 
284 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.33 
 
 
298 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.33 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.45 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.45 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.74 
 
 
292 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  33.61 
 
 
296 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.76 
 
 
299 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  34.83 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.98 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.67 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  34.82 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  34.83 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  34.83 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.43 
 
 
280 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  34.83 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4858  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  25.59 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  38.03 
 
 
297 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.15 
 
 
300 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  21.38 
 
 
278 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.47 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>