More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1494 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1494  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0915  two component transcriptional regulator  62.27 
 
 		 225 aa  232  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.65 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.38 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  42.14 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.03 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.65 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.65 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  44.65 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  44.38 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2500  winged helix family two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.840776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4903  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.14 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.654276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.9 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.9 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  39.35 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  39.35 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.99 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.62 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0920  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.88 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  38.96 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.4 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4031  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3989  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  37.58 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.22 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  33.96 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  32.66 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  35.85 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.98 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  42.68 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  41.21 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  34.76 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.59 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.14 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  37.82 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  38.61 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  41.25 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0752  hypothetical protein  36.48 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  37.65 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  37.42 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.85 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  43.83 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  39.88 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.77 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.51 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0781  hypothetical protein  35.85 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  42.41 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.4 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.19 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  37.04 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  37.04 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  37.04 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  41.04 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.35 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  37.04 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  37.04 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  37.04 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  37.04 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.05 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  41.73 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>