196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0136 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0136  putative integral membrane protein  100 
 
 
139 aa  262  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  62.71 
 
 
117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0090  putative integral membrane protein  71.93 
 
 
132 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1210  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17581  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.195056  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20851  integral membrane protein  34.45 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  47.56 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  38.94 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  36.52 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  37.04 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  31.45 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  24.24 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  41.44 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  26.67 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  33.33 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  40.21 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  31.9 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  36.05 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  37.25 
 
 
127 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
144 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  42.86 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  37.25 
 
 
127 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  28.18 
 
 
118 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  33.03 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  39.42 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  38.61 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  34.74 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  29.84 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1211  camphor resistance protein CrcB  28.23 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  31.67 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  30.4 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  35.04 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  29.03 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20861  hypothetical protein  28.23 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  35.71 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  32.76 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  52.08 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  52.08 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  52.08 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  37.65 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  36.96 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  32.31 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  34.15 
 
 
133 aa  47.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  32.43 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  33.9 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  34.41 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  31.4 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  29.17 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  26.89 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 
126 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  34.07 
 
 
130 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  35.07 
 
 
134 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  32.61 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  29.69 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  32.03 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0339  Camphor resistance CrcB protein  40.79 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  30.77 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2562  Camphor resistance CrcB protein  34.26 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  30.58 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  44.74 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  32.53 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>