81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0745 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  71.05 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  50.44 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  45.45 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  45.45 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  42 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  42.71 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  43.88 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  40.21 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  41 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  41.03 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  40.43 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  41.41 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  35.64 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  31.58 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  38.95 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  29.9 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  32.29 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  36.46 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  52.63 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  31.46 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  32.18 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  32.61 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  32.46 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  32 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  31.36 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  26.5 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  30.17 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  34.29 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  30.12 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  29.66 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  30.25 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20090  hypothetical protein  26.88 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.195136  normal  0.669354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  28.16 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0546  protein of unknown function DUF192  38.46 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.631878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  32.98 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1199  hypothetical protein  28.24 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.826524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  28.81 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  31.82 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  26.5 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  34.17 
 
 		 446 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  31.82 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  29.13 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  24.75 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  30.51 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1138  hypothetical protein  33.87 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  31.17 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0927  hypothetical protein  30.56 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  29.51 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  25 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  28.12 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  24.77 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  29.91 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  30.51 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  28.1 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  30.51 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  27.08 
 
 		 152 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  27.08 
 
 		 152 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  28.26 
 
 		 169 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  30.43 
 
 		 164 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  33.04 
 
 		 189 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  29.41 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  26.55 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  27.88 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  30.39 
 
 		 502 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  31.68 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  29.41 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  29.7 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  29.69 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  28.3 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  29.7 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  25.49 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  27.45 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>