65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1277 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  246  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  90.83 
 
 		 127 aa  219  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  57.85 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  50 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  41.82 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  44.21 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  38.94 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  40.91 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  36 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  38.74 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  53.85 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  35.45 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  35.29 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  36.46 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  38.98 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  38.98 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  38.98 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  31.46 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  31.73 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  36.04 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  32.58 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0257  protein of unknown function DUF192  35.78 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  35.24 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  34.91 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  31.78 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  34.31 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  26.36 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  30.63 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  34.78 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  34.78 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  34.38 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  30.39 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1138  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  31.9 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  27.12 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  30.28 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  30.28 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  31.19 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  36.27 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  24.14 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  31 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  27.36 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  26.72 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2491  protein of unknown function DUF192  36.11 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  34.91 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  28.71 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  34.09 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  33.8 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  40.91 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  25.66 
 
 		 163 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  29.73 
 
 		 114 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  26.92 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  34.38 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  30.65 
 
 		 446 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  32.11 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  26.79 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  25 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  26.36 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  31.88 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  32.67 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  34.92 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  31.34 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2427  protein of unknown function DUF192  34.65 
 
 		 120 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0913366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>