137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1050 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  34.65 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  38.54 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  32.48 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  30.26 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  32.8 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  33.04 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  35.24 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  26.53 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  32.58 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  35.77 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  35.58 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  33.59 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  30.97 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  39.58 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  35.58 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  35.58 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  30.08 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  30.3 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  36.96 
 
 
446 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  32.69 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  31.01 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  31.48 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  31.48 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  27.78 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1405  hypothetical protein  27.81 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542001  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  24.34 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  26.53 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  30.36 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  26.9 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  25.85 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  25.85 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  25.85 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  31.13 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  25.85 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  27.97 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  33.01 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  61.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  28.46 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  25.85 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  24 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  24.82 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  24 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  24 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  24 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  34.19 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  28.18 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  24.66 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  24.67 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  29.75 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  26.92 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  28.85 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2526  protein of unknown function DUF192  29.81 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.632185  normal  0.272559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  25 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  29.75 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  28.3 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  24.82 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  32.17 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  24.67 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  34.31 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  25 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  28.26 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  32.17 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  36.11 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  25.81 
 
 
187 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  29.59 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0419  protein of unknown function DUF192  26.28 
 
 
327 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  32.69 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  29.59 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  25.17 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  23.94 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  29.9 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  26.5 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  29.27 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  30.77 
 
 
217 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  36.23 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  31.73 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  30.93 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  27.85 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  29.06 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  31.68 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1832  protein of unknown function DUF192  32.74 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5719  hypothetical protein  28.85 
 
 
206 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  29.52 
 
 
163 aa  53.9  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  30.39 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  23.19 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  23.02 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  29.73 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  23.81 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  27.72 
 
 
188 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  26.32 
 
 
155 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  28.21 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  26.83 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  27.88 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.438373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>