121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2526 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2526  protein of unknown function DUF192  100 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.632185  normal  0.272559 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0419  protein of unknown function DUF192  48.05 
 
 
327 aa  128  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1832  protein of unknown function DUF192  48.09 
 
 
169 aa  121  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0442  protein of unknown function DUF192  44.88 
 
 
164 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3638  protein of unknown function DUF192  43.06 
 
 
204 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1384  protein of unknown function DUF192  41.3 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2241  protein of unknown function DUF192  42.74 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  31.58 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  28.67 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  31.21 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  31.21 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  41.51 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  29.82 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  31.58 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  40.57 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  40.57 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  31.48 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  35.23 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  35.23 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  35.23 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  35.23 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  26.71 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  31.13 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  24.8 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  35.23 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  35.23 
 
 
168 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  31.37 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  34.09 
 
 
171 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  31.47 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  34.55 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  32.95 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  34.09 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  29.81 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  32.03 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  34.09 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  35.23 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  35.23 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  35.23 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  35.23 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  35.23 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  30.7 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  35.23 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  35.23 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  27.87 
 
 
171 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  27.87 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  27.45 
 
 
201 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  27.45 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  30.7 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  25 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  25.53 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  26.14 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  28.95 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  30.21 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  37.11 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  28.7 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  38.05 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  32.29 
 
 
446 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  28.43 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  34.09 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  31.48 
 
 
217 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  35.16 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  25.53 
 
 
174 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  26.67 
 
 
152 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  27.78 
 
 
161 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  26.55 
 
 
156 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  26.47 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  34.74 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  29.8 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  32.99 
 
 
223 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  29.75 
 
 
171 aa  50.8  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  34.44 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  35.56 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  30.91 
 
 
173 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  35.05 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  36.08 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  35.05 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  26 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  26.26 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  27.1 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  32.99 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  27.52 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  35.05 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  28.81 
 
 
113 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  30.72 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0683  hypothetical protein  29.59 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  28.57 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  27.36 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  31.96 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  29.57 
 
 
160 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  27.4 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  28.57 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  28.78 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  30.11 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  32.58 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  30.63 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  30.63 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  21.24 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>