145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0860 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  50.92 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  52.05 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  44.16 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  49.31 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  47.75 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  46.85 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  46.85 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  47.57 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  41.82 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  42.11 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  42.34 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  45.05 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  41.82 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  39.68 
 
 		 163 aa  90.9  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  38.74 
 
 		 162 aa  90.5  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  40.17 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  38.85 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  38.3 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  44.04 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  38.26 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  38.46 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  45.13 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  38.74 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  38.98 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  39.84 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  40.54 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  38.89 
 
 		 189 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  49.02 
 
 		 151 aa  84.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  38.89 
 
 		 189 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  45.95 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  45.95 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  35.04 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  45.05 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  39.64 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  42.15 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  32.43 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  32.43 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  38.39 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  46.79 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  31.03 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  36.72 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  38.74 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  39.09 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  43.24 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  43.22 
 
 		 446 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  34.26 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  31.13 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  37.33 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  44.19 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  34.82 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  33.02 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  41.59 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  34.86 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  38.68 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  39.09 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  34.55 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  44.3 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  35.45 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  35.77 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  37.07 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  34.48 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  33.93 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  36.19 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  37.74 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  39.62 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  35.19 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  38.68 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  35.14 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  32.43 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  30.4 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  31.9 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  36.73 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  36.73 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  36.04 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  38.18 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  36.73 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  37.14 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  36.54 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  35.71 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  35.65 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  34.55 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  33.02 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  36.73 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19321  hypothetical protein  36.84 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  36.73 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  34.69 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  34.69 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>