143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2790 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  70.14 
 
 		 159 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  69.86 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  75.97 
 
 		 185 aa  201  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  75.4 
 
 		 159 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  66.44 
 
 		 163 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  58.59 
 
 		 184 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  56.45 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  55.65 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  55.65 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  54.03 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  55 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  55 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  53.91 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  52.46 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  48.44 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  47.92 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  53.28 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  47.86 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  47.06 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  40.67 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  47.86 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  51.92 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  43.65 
 
 		 172 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  46.22 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  47.9 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  37.33 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  37.33 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  46.55 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  40.8 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0696  hypothetical protein  40.91 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  41.61 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  41.67 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  40.52 
 
 		 178 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  42.4 
 
 		 189 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  42.4 
 
 		 189 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  41.53 
 
 		 189 aa  95.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  40.91 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  42.34 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  36.62 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  46.53 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  46.53 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  46.53 
 
 		 152 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  42.48 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  41.72 
 
 		 446 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  35.97 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3165  hypothetical protein  41.32 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.753693  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  41.28 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  46.08 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  41.58 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  32.68 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  40.87 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  44.12 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0833  hypothetical protein  39.02 
 
 		 165 aa  84  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.240367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1405  hypothetical protein  40.29 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  40.68 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  39.39 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  34.27 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  37.76 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  35.95 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  37.68 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  36.92 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  40 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  37.8 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  37.01 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  36.13 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  32.41 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  42.57 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1493  hypothetical protein  41.51 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  34.33 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  35.14 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  39.81 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  37.4 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  34.23 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  38.14 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  35.45 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  37.7 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  41.44 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  36.02 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  37.5 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  35.58 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  29.66 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  37.5 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  35.37 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  34.23 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  35.37 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  35.37 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  34.15 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  34.69 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  34.62 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  33.93 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  35.71 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  33.96 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  38.1 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>