78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1384 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1384  protein of unknown function DUF192  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3638  protein of unknown function DUF192  50 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0419  protein of unknown function DUF192  46.91 
 
 		 327 aa  115  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1832  protein of unknown function DUF192  44.09 
 
 		 169 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0442  protein of unknown function DUF192  42.98 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2526  protein of unknown function DUF192  41.3 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.632185  normal  0.272559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1445  hypothetical protein  68.25 
 
 		 160 aa  91.3  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.600161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2241  protein of unknown function DUF192  42.31 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  35.65 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  28.72 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  35.16 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  39.39 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  35.09 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  33.03 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  34.23 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  35.58 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  32.74 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  34.21 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  34.21 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  33.65 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  31.82 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  32.69 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  36.94 
 
 		 152 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  32 
 
 		 446 aa  51.6  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  33.94 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  40.91 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  32.17 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  26.36 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  33.04 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  29.01 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  28.21 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  31.3 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  31.9 
 
 		 164 aa  48.9  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  30.84 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  33.02 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  31.07 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  35.45 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  38.81 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  32.86 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  31.31 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  31.43 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  34.34 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  30.19 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  29.7 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  29.7 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  32.71 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  29.7 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3531  hypothetical protein  48.89 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  30.93 
 
 		 117 aa  45.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  28.45 
 
 		 155 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  27.36 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  36.92 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  27.36 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  34.55 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  29.37 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  31.78 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  28.39 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  26.17 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  31.73 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  27.83 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  31.07 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  31.13 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  29.36 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  27.36 
 
 		 164 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  37.88 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1493  hypothetical protein  32.14 
 
 		 137 aa  42  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  26.36 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  32.71 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  27.14 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>