141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1608 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  82.1 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  74.6 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  66.44 
 
 		 160 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  73.02 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  70.99 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  55.04 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  54.03 
 
 		 164 aa  133  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  53.08 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  51.61 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  51.61 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  50.82 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  50.83 
 
 		 176 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  50.83 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  49.23 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  44.08 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  43.2 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  50.39 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  41.73 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  48.36 
 
 		 210 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  47.57 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  44.19 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  45.63 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0833  hypothetical protein  42.74 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.240367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  45.3 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  42.37 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0696  hypothetical protein  45.37 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  40.32 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  39.37 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  39.37 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  41.6 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  40.32 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  41.86 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  40.32 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  41.86 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  44.14 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  46.08 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  45.28 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  37.4 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  45.13 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  35.62 
 
 		 173 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  44.35 
 
 		 170 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  41.53 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  48.45 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  46.53 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  39.82 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3165  hypothetical protein  38.66 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.753693  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  34.88 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  39.66 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  38.32 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  32.41 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  37.61 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  38.64 
 
 		 446 aa  78.2  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  43.14 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  42.31 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  42.31 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  42.31 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  39.67 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1405  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  40.52 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  40.57 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  33.06 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  29.05 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  34.55 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19321  hypothetical protein  35.2 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  34.51 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  36.61 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  33.6 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  35.59 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  39.05 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  38.57 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  41.12 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  31.82 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  36.6 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  36.5 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  35.19 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  36.7 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1493  hypothetical protein  36.11 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  35.78 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  30.88 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  34.58 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  37.96 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  38.74 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0683  hypothetical protein  34.92 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  34.19 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  33.65 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  41.89 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0916  hypothetical protein  31.82 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  32.41 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  29.51 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  44.93 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  31.53 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  44.93 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>