79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1679 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  90.83 
 
 
123 aa  219  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  57.5 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  50.44 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  37.96 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  41.82 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  43.16 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  40.91 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  40.74 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  34.91 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  38.89 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  56.92 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  35.45 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  37.25 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  41.53 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  41.53 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  36.94 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  37.3 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0257  protein of unknown function DUF192  37.61 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249837  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  28.18 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  34.58 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  31.73 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  32.18 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  36.7 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  35.85 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  36.19 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  30.63 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  33.03 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  34.78 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  34.78 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  32.32 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  33.71 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  32.32 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2491  protein of unknown function DUF192  35.85 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  32 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  33.94 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  27.45 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2427  protein of unknown function DUF192  38.32 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0913366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  27.72 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  26.32 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  38.61 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  27.19 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  29.41 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  33.04 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  31.45 
 
 
446 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  28.07 
 
 
148 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  31.52 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0442  protein of unknown function DUF192  26.32 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  25.58 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0419  protein of unknown function DUF192  29.13 
 
 
327 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1832  protein of unknown function DUF192  30.1 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  27.19 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1138  hypothetical protein  29.81 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  27.12 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  31.43 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  34.65 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  30.58 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  35.53 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5719  hypothetical protein  43.94 
 
 
206 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  34.34 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  39.39 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  28.16 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  28.7 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1384  protein of unknown function DUF192  31.13 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  28.33 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  28.33 
 
 
159 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  34.09 
 
 
126 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  29.41 
 
 
155 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  29.73 
 
 
114 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  29.52 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  32.81 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  32.63 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  30.58 
 
 
217 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  31.37 
 
 
180 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  26.8 
 
 
155 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>