41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4349 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  52.59 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  49.14 
 
 
116 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  44.55 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  41.58 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  41.58 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  39.56 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  36.61 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  48.75 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  35.65 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  39.36 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  45.36 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  41.98 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  33.03 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  41.49 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  37.23 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  34.51 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  33.7 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  42.68 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  34.58 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  38.14 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  32 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  34.04 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  31.78 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0546  protein of unknown function DUF192  40.32 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.631878  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  31.43 
 
 
160 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  25.47 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  22.12 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  35.78 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  34.86 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  34.86 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1832  protein of unknown function DUF192  38.46 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20090  hypothetical protein  32.04 
 
 
218 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.195136  normal  0.669354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  29.82 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  27.87 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  36.05 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0035  hypothetical protein  24.78 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0921527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  33.01 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  33.01 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>