41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2119 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  234  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  44.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  44.74 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  44.14 
 
 
113 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  40.71 
 
 
117 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  44.44 
 
 
113 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  38.39 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  39.82 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  42.71 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  38.89 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  37.96 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  34.82 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  36.73 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  38.46 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  39.78 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  37 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  37 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  41.41 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  38.71 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  34.29 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  33.03 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  31.07 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  34.94 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  33.02 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  32 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  26.45 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  46.43 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  28.33 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  25.42 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  29.06 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  25.42 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  25.42 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2491  protein of unknown function DUF192  25.69 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  25.42 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  27.43 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1199  hypothetical protein  29.35 
 
 
113 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.826524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2572  protein of unknown function DUF192  29.41 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0423925  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20090  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.195136  normal  0.669354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>