29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0250 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  313  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  40.45 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  44.07 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  34.38 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  52.38 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  31.43 
 
 
114 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  36.46 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  34.55 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  38.16 
 
 
115 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  38.75 
 
 
118 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  37.61 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  44.26 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  29 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  32.73 
 
 
120 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  36.61 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  40.32 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  32.81 
 
 
113 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  32.2 
 
 
123 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  35.05 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  35.05 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  34.02 
 
 
127 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  24.07 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  40.85 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  39.44 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0546  protein of unknown function DUF192  46.51 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.631878  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  30.3 
 
 
126 aa  40.8  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  40.3 
 
 
116 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  25.25 
 
 
111 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>