45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1052 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  100 
 
 		 113 aa  227  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  91.15 
 
 		 113 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  53.64 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  44.64 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  41.82 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  46.79 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  43.64 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  41.82 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  40.74 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  40.91 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  44 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  36.19 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  42.16 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  52.17 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  42.16 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  36.46 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1199  hypothetical protein  31.73 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.826524  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  38.14 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  32.41 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  44.26 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  40.22 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  42.86 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  35.87 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  36.7 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  37.97 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  38.1 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1138  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  36.71 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  36.71 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  53.19 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0442  protein of unknown function DUF192  30.33 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0927  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  32.18 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2491  protein of unknown function DUF192  41.05 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  29.35 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  30.7 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  32.73 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  26.09 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  30.09 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2572  protein of unknown function DUF192  40.22 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  30.84 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>