30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0927 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0927  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  224  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  90.09 
 
 
111 aa  207  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  86.49 
 
 
111 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1199  hypothetical protein  68.75 
 
 
113 aa  159  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.826524  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1138  hypothetical protein  69.57 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  36.46 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  28.28 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  32.29 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  31.87 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  32.18 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  30.59 
 
 
118 aa  48.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  35.44 
 
 
120 aa  48.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  28.42 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  32.18 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  38.46 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  34.18 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  31.82 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  32.22 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  32.88 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  30.56 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  32.99 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2491  protein of unknown function DUF192  27.38 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  32.43 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3165  hypothetical protein  25.77 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.753693  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  29.59 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  26.67 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  32.35 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  34.29 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>