45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3209 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  91.15 
 
 		 113 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  53.1 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  44.14 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  45.54 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  42.34 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  45.05 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  46.36 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  42.59 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  40.74 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  33.94 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  45.63 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  45 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  45.63 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  55.07 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  41.49 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  39.18 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1199  hypothetical protein  32.04 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.826524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  48.39 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  35.19 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  47.62 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  42.86 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  59.57 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  39.13 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  40.98 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1138  hypothetical protein  32.5 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  32.74 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0927  hypothetical protein  31.87 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  31.87 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  31.86 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  31.86 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  34.51 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  28.57 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  35.51 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  32.58 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2572  protein of unknown function DUF192  41.3 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2491  protein of unknown function DUF192  41.05 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  25.86 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0442  protein of unknown function DUF192  29.51 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  30.84 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20090  hypothetical protein  36.21 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.195136  normal  0.669354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>