32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6879 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  100 
 
 		 116 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  79.31 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  49.14 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  44.76 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  46.74 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  46.74 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  45.63 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  29.9 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  42.16 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  50 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  38.71 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  34.91 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  34.34 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  30.77 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  39.78 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  33.64 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  48.48 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  35.85 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  31.25 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  34.91 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  32.11 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  24.76 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  28.16 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  33.62 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  40.85 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0442  protein of unknown function DUF192  28.44 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20090  hypothetical protein  34.33 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.195136  normal  0.669354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0546  protein of unknown function DUF192  33.71 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.631878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>