44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2872 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  99.31 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  37.72 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  36.36 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  40.21 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  46.74 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  41.58 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  46.67 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  42.11 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  47.37 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  32.43 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  41.38 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  33.04 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  34.31 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  33.04 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  34.74 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  36.27 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  48.39 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  42.86 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  34.52 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  34.78 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.826524  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0927  hypothetical protein  32.18 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  30.68 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  30.28 
 
 		 446 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  25.45 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  26.21 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2526  protein of unknown function DUF192  30.63 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.632185  normal  0.272559 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  29.55 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  24.07 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0546  protein of unknown function DUF192  46.15 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.631878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1138  hypothetical protein  24.74 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  23.42 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  32.29 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  29.73 
 
 		 168 aa  41.2  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  23.08 
 
 		 168 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  35.71 
 
 		 502 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  30.93 
 
 		 514 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>