36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2924 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  228  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  79.31 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  52.59 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  39.45 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  46.67 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  46.67 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  44.32 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  34.82 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  45.63 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  38.1 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  33.96 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  37.78 
 
 		 118 aa  67  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  42.16 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  34.34 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  37.35 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  53.73 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  36.46 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  44.71 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  35.16 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  32.14 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  45.45 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  28.57 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2526  protein of unknown function DUF192  31.13 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.632185  normal  0.272559 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1832  protein of unknown function DUF192  28.16 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0442  protein of unknown function DUF192  30.7 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  29.91 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  29.91 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  28.57 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  27.83 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20090  hypothetical protein  32.56 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.195136  normal  0.669354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  30.84 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  39.66 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>