35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2113 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  100 
 
 
144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  44.76 
 
 
116 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  40.43 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  45.98 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  44.55 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  57.69 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  42.11 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  42.11 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  38.46 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  38.1 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  39.76 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  46.32 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  36.73 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  33.98 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  31.73 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  35.96 
 
 
135 aa  57.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  35.71 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  39.13 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  40.22 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2572  protein of unknown function DUF192  37.74 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0423925  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  36.46 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  36.96 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  43.75 
 
 
161 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  38.96 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0916  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0546  protein of unknown function DUF192  40 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.631878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  38.61 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  36.27 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  33.98 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1493  hypothetical protein  31.19 
 
 
137 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  30.88 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  27.71 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0927  hypothetical protein  32.35 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>