38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0711 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  50.44 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  53.98 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  46.94 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  40.21 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  40.21 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  44.57 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  36.61 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  35.71 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  34.82 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  46.25 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  37.11 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  35.42 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  35.42 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  36.17 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  37.25 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  45.59 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  39.18 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  38.54 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  32.29 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  35.11 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  32.58 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  33.71 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  35.06 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  32.05 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  27.43 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  27.62 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1199  hypothetical protein  25.81 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.826524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  25.23 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  29.31 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0927  hypothetical protein  32.43 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  32.11 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  28.21 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  27.68 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  31.19 
 
 		 152 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  31.19 
 
 		 152 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>