24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13070 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  311  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0546  protein of unknown function DUF192  44.21 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.631878  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20090  hypothetical protein  39.56 
 
 
218 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.195136  normal  0.669354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  45.45 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  42.42 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  42.68 
 
 
116 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  45.57 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  48.48 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  45.45 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  59.57 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  35.71 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  38.67 
 
 
113 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  38.96 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  35.11 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  42.19 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  35.06 
 
 
114 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  46.43 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  53.19 
 
 
113 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  31.17 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  44.44 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  44.44 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  32.69 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  40.74 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>