144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2570 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  38.41 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  41.26 
 
 
150 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  43.24 
 
 
223 aa  103  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  37.16 
 
 
162 aa  103  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  48.74 
 
 
217 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  41.44 
 
 
147 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  41.82 
 
 
164 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  37.09 
 
 
155 aa  100  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  36.6 
 
 
163 aa  100  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  52.58 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  39.6 
 
 
177 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  40.41 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  37.5 
 
 
161 aa  97.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  43.62 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  42.86 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  40.27 
 
 
153 aa  97.1  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  42.14 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  40.27 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  36.79 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  36.23 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  40.28 
 
 
163 aa  94.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  34.48 
 
 
180 aa  94  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  37.19 
 
 
168 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  34.97 
 
 
164 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  35.92 
 
 
201 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  43.4 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  36.84 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  43.64 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  37.84 
 
 
171 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  42.28 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  42.28 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  41.9 
 
 
168 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  38.6 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  37.82 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1009  protein of unknown function DUF192  43.7 
 
 
159 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.480683  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  38.53 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  39.13 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  39.32 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  41.46 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  35.94 
 
 
154 aa  87  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  44.66 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  37.41 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  32.8 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  30.38 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  33.11 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  45.56 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  45.56 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  42.39 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  42.39 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  41.3 
 
 
172 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  37.01 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  31.36 
 
 
178 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  34.69 
 
 
159 aa  84  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  37.16 
 
 
177 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  42.55 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  42.55 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  40.22 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  44.32 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  44.32 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  42.55 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  42.55 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  32.08 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  44.32 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  33.94 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  42.55 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  42.55 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  40.19 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  32.37 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  38.1 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  48.28 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  39.32 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  35.9 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  38.82 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  34 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  39.5 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3165  hypothetical protein  37.93 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.753693  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  29.49 
 
 
168 aa  77  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  40.35 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  36.75 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  36.61 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  35.77 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  36.75 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  36.61 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  38.84 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5719  hypothetical protein  45.36 
 
 
206 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  38.66 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  40.5 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  39.67 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  36.75 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  38.32 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0683  hypothetical protein  36.11 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  41.12 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  37.82 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  37.84 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  36.36 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0419  protein of unknown function DUF192  35.38 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  34.48 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>