136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3244 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  100 
 
 
181 aa  366  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  58.54 
 
 
155 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  58.59 
 
 
152 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  58.59 
 
 
152 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  57.81 
 
 
152 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  42.19 
 
 
157 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  46.09 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  45.05 
 
 
168 aa  96.7  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  42.06 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  32.06 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  42.57 
 
 
171 aa  88.6  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  47.22 
 
 
145 aa  88.2  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  43.14 
 
 
165 aa  87.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  46.36 
 
 
171 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  46.36 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  38.76 
 
 
187 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  44.55 
 
 
163 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  37.5 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  39.68 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  47.06 
 
 
159 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  35.14 
 
 
168 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  42.31 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  40.78 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  35.51 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  45.1 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  39.81 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  47.06 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  38.46 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  37.82 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  37.86 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  32.11 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  37.62 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  46.79 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  43.56 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  31.58 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  35.58 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  44.34 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  37.61 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  40.2 
 
 
162 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  44.12 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  36 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  34.06 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  42.72 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  43.56 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  43.14 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  37.61 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  38 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  36.63 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  32.86 
 
 
223 aa  77.8  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  39.42 
 
 
217 aa  77.4  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  35.82 
 
 
153 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  38 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  35.82 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  47.06 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  45.45 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  42.57 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  39.22 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  39.42 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  41.58 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  39.05 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  41.58 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  32.82 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  40.59 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  43.16 
 
 
151 aa  72  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0419  protein of unknown function DUF192  31.06 
 
 
327 aa  71.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  35.19 
 
 
446 aa  71.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  38.53 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  30.56 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  35.58 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  30.11 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  36.54 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  38.3 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  30.11 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  32.71 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  35.58 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  37.62 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  34.65 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  34.65 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  35.79 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  29.55 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  36.84 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  37.14 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  36.84 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  29.55 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  41.94 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  38.78 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  37.62 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  29.55 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  29.55 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  35.92 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  31.3 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  31.14 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  38.61 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  34.74 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  38.46 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>