139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3171 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  100 
 
 		 172 aa  356  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  88.37 
 
 		 171 aa  298  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  91.28 
 
 		 168 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  72.09 
 
 		 166 aa  263  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  73.26 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  73.84 
 
 		 171 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  73.26 
 
 		 177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  72.67 
 
 		 166 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  72.09 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  72.09 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  73.99 
 
 		 169 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  72.09 
 
 		 166 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  73.41 
 
 		 169 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  73.41 
 
 		 169 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  73.41 
 
 		 169 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  73.41 
 
 		 169 aa  236  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  72.83 
 
 		 169 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  53.95 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  53.95 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  53.06 
 
 		 160 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  51.7 
 
 		 201 aa  153  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  51.66 
 
 		 150 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  46.15 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  56.78 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  47.92 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  55.93 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  48.3 
 
 		 164 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  49.61 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  44.37 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  46.28 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  46.28 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  41.36 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  45.45 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  47.06 
 
 		 155 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  43.51 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  46.09 
 
 		 145 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  43.87 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  42.74 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  43.41 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  40.83 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  41.82 
 
 		 217 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  40.54 
 
 		 223 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  40.95 
 
 		 155 aa  90.9  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  43.14 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  40.57 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  40.57 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  39.81 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  37.9 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  36.04 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  33.09 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  36.13 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  36.8 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  37.5 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  36.15 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  37.27 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  38.83 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  34.96 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  37.61 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  36.7 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  35.21 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  32.14 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  36.09 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  38.89 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  38.18 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  33.64 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  34.81 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  32.14 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  37.5 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  34.26 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  35.45 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1009  protein of unknown function DUF192  30.07 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5719  hypothetical protein  44.87 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  44.93 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  31.67 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  34.26 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  31.13 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0419  protein of unknown function DUF192  35.58 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  30.82 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  38.71 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  32.04 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  22.67 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  33.74 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  33.01 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  34.65 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  34.65 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  34.31 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  33.96 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  35.19 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  35 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  35 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  32.11 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>