139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0550 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  100 
 
 		 169 aa  342  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  71.31 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  61.16 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  60.33 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  58.54 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  60.5 
 
 		 176 aa  151  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  60.5 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  59.5 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  59.5 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  55.28 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  54.84 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  55.65 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  50.41 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  50.81 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  50.83 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  49.23 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  46.77 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  39.74 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  53.77 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  53.77 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  53.77 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  49.51 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  40.14 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  40.14 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  39.49 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  50.94 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  43.7 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  47.17 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  45.83 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  39.66 
 
 		 210 aa  96.3  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  46.09 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  42.98 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  37.12 
 
 		 159 aa  94.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  43.43 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  47.62 
 
 		 170 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  40.37 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  44.44 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  41.51 
 
 		 171 aa  90.9  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  40.16 
 
 		 189 aa  90.5  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  44.04 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  42.31 
 
 		 142 aa  87.4  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  38.81 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  41.53 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  41.18 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  39.06 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  36.89 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0696  hypothetical protein  39.34 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  39.83 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  39.83 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  35.04 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  35.04 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  37.24 
 
 		 201 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  40.78 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  37.04 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  32.14 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  37.4 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0833  hypothetical protein  33.12 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.240367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  41.23 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  37.38 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3284  protein of unknown function DUF192  42.31 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  38.1 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1405  hypothetical protein  34.15 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  37.86 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  38.24 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3165  hypothetical protein  38.46 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.753693  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  35.42 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  35.04 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  35.85 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1493  hypothetical protein  39.05 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  40.21 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  36.28 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  36.92 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  38.14 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  36.43 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  31.74 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  36.19 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  42.31 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  37.38 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  37.17 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  36.92 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  41 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  40.59 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  35.58 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  41 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  30.41 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  39.82 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  33.1 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  32.98 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 446 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  32.68 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  32.43 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0916  hypothetical protein  38.39 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  35.66 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  27.92 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1009  protein of unknown function DUF192  37.25 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>