144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2556 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  50.67 
 
 
156 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  53.28 
 
 
160 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  51.72 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  53.97 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  52.14 
 
 
184 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  56.14 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  54.24 
 
 
169 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  45.57 
 
 
165 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  51.16 
 
 
171 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  50.39 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  53.91 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  53.91 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  53.92 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  48.28 
 
 
185 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  53.92 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  52.1 
 
 
170 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  50.86 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  51.26 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  48.08 
 
 
159 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  43.51 
 
 
170 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  44.2 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  53.04 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  44.96 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0696  hypothetical protein  46.34 
 
 
161 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  46.55 
 
 
162 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  44.16 
 
 
173 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  47.12 
 
 
161 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  40.56 
 
 
187 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  37.34 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  47.06 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  41.04 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3165  hypothetical protein  42.15 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.753693  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  38.85 
 
 
189 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  38.85 
 
 
189 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  47.17 
 
 
171 aa  94  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  40.79 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  44.83 
 
 
156 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  91.7  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  47.62 
 
 
181 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  35.66 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  35.66 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  33.78 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  41.67 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  41.67 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  42.02 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  42.61 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  35.06 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  43.81 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  39.13 
 
 
172 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  37.74 
 
 
210 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  39.67 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  40.34 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  41.72 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0833  hypothetical protein  32.89 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.240367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  36.19 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  37.68 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  38.39 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1405  hypothetical protein  41.67 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542001  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  40.94 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  35.95 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  37.98 
 
 
446 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  44.76 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1493  hypothetical protein  40.46 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  38.3 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  34.84 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  36.21 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  36.07 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  37.04 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  41 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  37.96 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  39.81 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  37.67 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  29.93 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  36.13 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  36 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  36.99 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  38.1 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  36.5 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0916  hypothetical protein  41.96 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  39 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  34.65 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  33.03 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  36.43 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  34.17 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  35.19 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  34.48 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  37.07 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  38.89 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  37.96 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  35.43 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  35.17 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  40.2 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0035  hypothetical protein  29.41 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0921527  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  35.71 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19321  hypothetical protein  39.42 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  34.69 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  35.17 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>