140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2782 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  55.97 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  54.09 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  62.4 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  50.6 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  53.46 
 
 		 171 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  58.45 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  51.55 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  60.47 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  53.42 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  50.94 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  56.15 
 
 		 152 aa  160  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  60.17 
 
 		 150 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  53.24 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  52.45 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  51.75 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  47.95 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  49.61 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  48.12 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  47.47 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  47.47 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  48.25 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  47.47 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  54.7 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  49.3 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  48.55 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  48.55 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  49.3 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  48.55 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  46.84 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  47.55 
 
 		 169 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  54.87 
 
 		 145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  52.99 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  49.61 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  53.45 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  49.61 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  53.39 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  50.44 
 
 		 217 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  48.21 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  43.66 
 
 		 143 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  40.41 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  47.66 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  47.66 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  46.73 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  43.28 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  38.06 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  43.86 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  37.41 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  35.33 
 
 		 154 aa  95.9  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  40.87 
 
 		 152 aa  94.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  45.28 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  41.46 
 
 		 163 aa  91.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  43.69 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  35.97 
 
 		 161 aa  87.8  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  38.35 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  41.18 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  37.93 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  33.81 
 
 		 155 aa  84.7  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  40.37 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  40.78 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  42.98 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  44.44 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  40.57 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  44.44 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  38.98 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  37.93 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  37.76 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  43.93 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  42.05 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  38.14 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  34.25 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  38.32 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  32.48 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  38.41 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  26.14 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  37.86 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  37.16 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  36.44 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  36.44 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  34.21 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  41.18 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  42.15 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  32.85 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  36.89 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  34.11 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  39.81 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  38.4 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  31.58 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  36.6 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  43.62 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  45.71 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  38.6 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  34.17 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5719  hypothetical protein  40.45 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  33.59 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  33.59 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>