140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1448 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  330  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  53.06 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  53.21 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  55.08 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  54.24 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  55 
 
 		 164 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  46.67 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  54.17 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  55.26 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  55.26 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  46.53 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  50.85 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  51.28 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  48.18 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  45.39 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  48.72 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  47.01 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  47.01 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  50.49 
 
 		 185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  41.04 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1645  hypothetical protein  45.83 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0289235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  39.57 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  47.57 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  41.8 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  38.36 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  40.16 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  40.16 
 
 		 145 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  39.61 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  41.53 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  35.14 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  36.11 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  40.14 
 
 		 177 aa  94  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  38.76 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0696  hypothetical protein  38.4 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  41.38 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  36.24 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  39.84 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  44.55 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  41.38 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  43.24 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  41.38 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  43.93 
 
 		 170 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  34.78 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  40.87 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  36.91 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  35.16 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  38.05 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  39.17 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  42.99 
 
 		 168 aa  87.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  35.61 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  35.61 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  39.29 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  42.99 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  45 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  35.07 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  38.84 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  47.06 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  44.55 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  42.31 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  36.89 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  43.88 
 
 		 171 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  36.62 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0833  hypothetical protein  43.14 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.240367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  45.1 
 
 		 177 aa  84  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  43.14 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  36.36 
 
 		 446 aa  84  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  45.36 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  45.36 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  39.25 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  45.74 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  41.58 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  37.39 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  31.21 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  37.17 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  41.23 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  39.84 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  41.51 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  43.43 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  41.23 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  33.82 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  41.58 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  41.58 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  41.58 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  41.58 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  41.58 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  41.58 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  40.59 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1405  hypothetical protein  40.37 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  32.89 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  35.42 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  37.27 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  32 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  39.45 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  36.84 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  39.45 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  33.1 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  36.49 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>