141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2299 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  350  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  98.21 
 
 
168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  63.86 
 
 
180 aa  214  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  62.35 
 
 
174 aa  214  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  76 
 
 
164 aa  211  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  62.99 
 
 
187 aa  210  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  67.65 
 
 
150 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  63.06 
 
 
164 aa  200  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  65.91 
 
 
152 aa  197  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  53.46 
 
 
177 aa  174  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  62.7 
 
 
155 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  55.37 
 
 
201 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  49.32 
 
 
160 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  52.59 
 
 
147 aa  154  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  45.39 
 
 
153 aa  153  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  45.39 
 
 
153 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  46.5 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  51.24 
 
 
150 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  43.14 
 
 
150 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  52.14 
 
 
155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  46.81 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  43.04 
 
 
166 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  43.67 
 
 
166 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  43.67 
 
 
166 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  43.67 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  51.33 
 
 
145 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  43.04 
 
 
177 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  41.07 
 
 
169 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  41.07 
 
 
169 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  41.07 
 
 
169 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  40.48 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  41.28 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  38.1 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  41.77 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  46.02 
 
 
223 aa  117  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  40.7 
 
 
169 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  41.25 
 
 
166 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  45.45 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  45.45 
 
 
172 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  45.54 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  44.12 
 
 
171 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  39.66 
 
 
143 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  38.21 
 
 
156 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  38.62 
 
 
154 aa  97.4  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  33.54 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  38.85 
 
 
163 aa  94  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  37.12 
 
 
155 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  37.84 
 
 
152 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  32.24 
 
 
155 aa  90.5  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  43.36 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  36.73 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  43.36 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  34.35 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  35.45 
 
 
174 aa  89  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  42.48 
 
 
152 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  34.31 
 
 
155 aa  89  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  39.62 
 
 
168 aa  87.8  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  37.93 
 
 
159 aa  87.8  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  42.2 
 
 
169 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  42.99 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  38.68 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  35.19 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  42.2 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  41.82 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  36.81 
 
 
159 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  38.02 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  42.74 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  40.57 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  35.51 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4175  hypothetical protein  38.89 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  39.09 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  35.78 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  36.63 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  40.17 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  37.74 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  32.65 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  38 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  40.37 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  29.13 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  39 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  35.34 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  38.14 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  33.06 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  38.14 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  37.31 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0833  hypothetical protein  32.46 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.240367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  33.63 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  32.24 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  35.9 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0683  hypothetical protein  33 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  36.67 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1009  protein of unknown function DUF192  36.19 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.480683  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  38.18 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  39.62 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  34.31 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  33.63 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  35.85 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>